Quelques mois plus tard il est à nouveau en France pour des essais au Havre, mais cette fois il repartira avec des papiers et un contrat avec le Real Madrid. Il a alors 15 ans. Quand il arrive au Real Madrid, on oublie de venir le chercher à l'aéroport.
Prêté à ainsi au Leganes pour la saison 97/98 (club de 2e division espagnole), il joue 28 matches et marque trois fois avant de retourner au Real de Madrid qu'il quitte de nouveau après avoir joué un seul match de toute la saison. Mais c'est au centre de formation du prestigieux Real Madrid que le jeune Samuel fait ses classes. On le prédit grand espoir du football mondial. Seulement voilà, le Real ne le fait pas jouer et le prête à Majorque. Il passe 4 saisons extraordinaires à Majorque (2000-2004). Lors de la saison 2003/2004, il atteint avec Majorque, le 4e tour de la Coupe de l'UEFA (Union Européenne de Football Association). Là, le footballeur est titulaire et progresse rapidement. Vainqueur des Jeux Olympiques en 2000 et de retour au Real Madrid, il ne joue toujours pas et retourne à Majorque. Il en gardera un profond ressentiment envers Madrid. Suivent quatre ans plein sous le maillot rouge où il marque de plus en plus de buts. Il joue même un très mauvais tour au Real, l'année de son centenaire, en remportant contre toute attente la Copa del Rey avec Majorque. En Coupe d'Afrique des nations 2000 et 2002, il assure la domination du Cameroun sur le continent en remportant la compétition